Salah satu hal unik lain di Vihara Gunung Kalong ini ditunjukkan dengan adanya toleransi beragama. Lokasi vihara bersampingan dengan Makam Ki Mandung.
Di malam-malam tertentu, Makam Ki Mandung yang ramai dengan prosesi nyadran oleh para peziarah ternyata bersamaan dengan upacara keagamaan bagi penganut agama Buddha yang dilakukan di vihara.
Wisata Vihara Gunung Kalong ini terbuka untuk umum setiap harinya. Tepatnya pada pukul 07.00 – 21.00. Di vihara ini, pengunjung juga dapat melihat patung Dewi Kwan Im setinggi 7 meter berdiri dengan kokoh.