Sepanjang kariernya di berbagai bidang, Ignasius Jonan menerima berbagai penghargaan. Berdasarkan informasi dari laman Ikatan Akuntan Indonesia, ia dianugerahi Penghargaan Akuntan Award pada tahun 2013 dan 2019. Selain itu, ia juga berkontribusi di bidang pendidikan dengan menerima gelar Doktor Kehormatan (Doktor Honoris Causa) dari Universitas Airlangga (Unair) Surabaya pada tahun 2021.
Saat ini, Jonan aktif dalam dunia konsultasi sebagai Penasihat Senior di Accenture Indonesia. Selain itu, ia juga menjabat sebagai Komisaris Utama/Independen di PT Anabatic Technologies Tbk sejak 2021.
Pada 15 November 2023, Ignasius Jonan menerima penghargaan Bintang Ordo Gregorius Agung dan diangkat sebagai Komandan Ksatria St. Gregorius Agung. Penghargaan ini diberikan dalam rangka perayaan 10 tahun kepemimpinan Paus Fransiskus dan diserahkan oleh Duta Besar Vatikan untuk Indonesia, Mgr. Piero Piopo, dalam sebuah acara di Nunsiatura atau Kedutaan Besar Vatikan di Jakarta. (*)